Плодовое дерево состоит из двух основных частей — подземной и надземной. Подземная часть — это корень, а надземная —стебель, листья. Эти органы называются вегетативными. Кроме них, имеются еще репродуктивные органы, воспроизводящие потомство. К ним относятся плодовая почка, цветок, семена и плод.

Корневая система — основа растения, на ней держится вся надземная часть. Корни придают устойчивость растению, поглощают из почвы воду с растворенными в ней минеральными солями, накапливают пита?

Вещества, участвуют в синтезе углеводов и кислот, часто служат органом размножения и т. д. Корневая система состоит из скелетных и обрастающих частей. Скелетная часть — это основа, на которой развиваются боковые и придаточные корни.

Главный, или стержневый, корень появляется из центрального зародышевого корешка. От него отходят боковые корни второго порядка, от которых, в свою очередь, корни третьего, четвертого и других порядков.

На главном и боковых корнях возникают обрастающие корни, которые состоят из мочек и корневых волосков. Кончик корня защищен чехликом, за которым идет зона роста, затем располагаются всасывающая зона и проводящая часть.

Корневые мочки (молодые корешки) играют огромную роль в жизни растительного организма. Они, кроме поглощения почвенного раствора, выполняют еще одну очень важную функцию: поглощаемый неорганический азот превращается ими в органический. Вместе с тем мочковатые корни обеспечивают поступательный рост корней. Они недолговечны, обычно к осени погибают, а весной на их место появляются новые.

Древесные плодовые культуры имеют мощную, далеко идущую вглубь и в стороны корневую систему. Наиболее глубоко в почву уходят корни яблони, груши и вишни. В среднем основная масса корней залегает на глубине от 40 см до 2 метров.

Характер распространения корней в почве зависит от вида растения и применяемой агротехники. Чем выше уровень агротехники в саду, тем лучше деятельность корней. 
В зоне распространения корней развивается микрофлора. Это имеет огромное значение для жизни дерева.

Надземная часть плодового растения состоит из корневой шейки и стебля. Корневая шейка находится у поверхности почвы между надземной и подземной частями растения, то-есть .где корни переходят в ствол. У растений, развивающихся из семян (у сеянцев), она образуется из подсемядольного колена и называется в этом случае типичной корневой шейкой. У растений, полученных путем вегетативного размножения (черенками, отводками) корневой шейки, естественно, не может быть, под корневой шейкой подразумевают границу между корнями и стеблем и называют ее поэтому условной. Стебель состоит из вертикальной части (ствола), которая несет на себе- все остальные части дерева; сучья, ветви, листья, почки, цветы и плоды.